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宏基因組學(xué)作為確定農(nóng)業(yè)管理實(shí)踐如何影響人類和動物健康的有力工具而受到關(guān)注,特別是在促進(jìn)抗生素耐藥性傳播的潛力方面。然而,如果不對已發(fā)布的數(shù)據(jù)集進(jìn)行完整的重新分析,就不可能比較多個研究和環(huán)境中抗生素抗性基因 (ARG) 的分布和流行程度。
在 NIFA 的支持下,弗吉尼亞理工大學(xué)的研究人員創(chuàng)建了AgroSeekundefined,這是一個基于網(wǎng)絡(luò)的集中式系統(tǒng),提供分析和比較宏基因組數(shù)據(jù)集的工具,專門為研究人員和農(nóng)業(yè)部門的其他用戶定制,這些用戶對跟蹤和減輕 ARGs 的傳播感興趣.AgroSeek 利用用戶提供的豐富的宏基因組數(shù)據(jù)和元數(shù)據(jù),以用戶友好的方式促進(jìn)分析、比較和預(yù)測。AgroSeek 從公共數(shù)據(jù)集中提取數(shù)據(jù),為數(shù)據(jù)分析提供比較點(diǎn)和背景。
這種易于使用的工具還為宏基因組數(shù)據(jù)共享和協(xié)作創(chuàng)造了空間,以協(xié)助決策者、利益相關(guān)者和公眾進(jìn)行決策。
田納西大學(xué)科學(xué)家開發(fā)出家禽抗生素替代品
2017 年,F(xiàn)DA 逐步停止在食用動物的動物生產(chǎn)中使用飼料中具有重要醫(yī)學(xué)意義的抗生素來促進(jìn)生長。由于這項(xiàng) FDA 法規(guī),農(nóng)業(yè)中的 AMR 細(xì)菌立即顯著減少,而人類的 AMR 細(xì)菌沒有變化。然而,限制抗生素使用會損害生產(chǎn)效率和動物健康。因此,迫切需要開發(fā)有效的抗生素替代品。
田納西大學(xué)的科學(xué)家們開發(fā)了兩種創(chuàng)新的小分子,即膽鹽水解酶抑制劑和宿主防御肽誘導(dǎo)化合物,作為抗生素的替代品,用于家禽的生長促進(jìn)和疾病控制。然后,他們使用創(chuàng)新且具有成本效益的封裝技術(shù)來進(jìn)一步提高這些天然化合物在商業(yè)應(yīng)用中的有效性。
作為這項(xiàng)工作的結(jié)果,研究人員發(fā)現(xiàn)丁酸鹽和毛喉素在增強(qiáng)先天免疫、屏障功能和抗病能力方面具有很強(qiáng)的協(xié)同作用,而不會引發(fā)炎癥細(xì)胞因子基因表達(dá)。他們發(fā)現(xiàn)丁酸鹽、毛喉素和乳糖在促進(jìn)先天免疫和抗病性方面具有很強(qiáng)的協(xié)同作用。他們發(fā)現(xiàn)丁酸鹽和糖在誘導(dǎo)宿主防御肽基因表達(dá)方面具有很強(qiáng)的協(xié)同作用。他們還發(fā)現(xiàn)丁酸鹽和環(huán)氧合酶 2 抑制劑之間存在很強(qiáng)的協(xié)同作用,可誘導(dǎo)宿主防御肽基因表達(dá)。
研究人員預(yù)計(jì)該項(xiàng)目將導(dǎo)致開發(fā)兩種創(chuàng)新的非抗生素喂養(yǎng)技術(shù),以便在家禽和可能的其他牲畜中立即采用和商業(yè)化,從而減輕整個食物鏈的 AMR。
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