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尋找缺失的網(wǎng)絡(luò)鏈接可以幫助開(kāi)發(fā)新藥 阻止疾病 緩解交通

2019-06-26 11:22:44 編輯: 來(lái)源:
導(dǎo)讀 一個(gè)新的網(wǎng)絡(luò)結(jié)構(gòu)數(shù)學(xué)模型可以幫助找到新的抗癌藥物,加快交通流量和對(duì)抗性傳播疾病。雖然這三個(gè)挑戰(zhàn)看起來(lái)多種多樣,但它們都可以從一個(gè)有

一個(gè)新的網(wǎng)絡(luò)結(jié)構(gòu)數(shù)學(xué)模型可以幫助找到新的抗癌藥物,加快交通流量和對(duì)抗性傳播疾病。

雖然這三個(gè)挑戰(zhàn)看起來(lái)多種多樣,但它們都可以從一個(gè)有助于通過(guò)分析網(wǎng)絡(luò)結(jié)構(gòu)來(lái)發(fā)現(xiàn)網(wǎng)絡(luò)未知信息的理論中獲益。

西澳大利亞大學(xué)的團(tuán)隊(duì)成員Michael Small表示,填寫(xiě)缺失環(huán)節(jié)可能有用的一個(gè)例子是選擇癌癥藥物的遺傳目標(biāo)。

“假設(shè)你有一個(gè)以某種方式連接的基因網(wǎng)絡(luò),并且有一些已知的藥物靶標(biāo)。但如果你不知道所有的基因,你想猜測(cè)你不需要弄清楚的是什么可能是其他可能的調(diào)查目標(biāo),“Small說(shuō)。

成功的鏈路預(yù)測(cè)算法已經(jīng)存在于某些類型的網(wǎng)絡(luò),但研究人員分析了不同結(jié)構(gòu)的網(wǎng)絡(luò),以提出他們的替代算法。

傳統(tǒng)鏈接預(yù)測(cè)的示例可以是建議與之連接的朋友的社交網(wǎng)絡(luò)。分享朋友的兩個(gè)人很可能自己是直接聯(lián)系的朋友。添加此第三個(gè)連接會(huì)創(chuàng)建一個(gè)三角形,這是現(xiàn)有算法所關(guān)注的結(jié)構(gòu)。

相比之下,作者關(guān)注的是樹(shù)狀網(wǎng)絡(luò),它有許多分支,但分支之間的交叉鏈接很少。他們研究了三個(gè)示例數(shù)據(jù)集:社交網(wǎng)絡(luò)Twitter,配水網(wǎng)絡(luò)和性接觸網(wǎng)絡(luò)。

他們發(fā)現(xiàn)這三個(gè)樹(shù)狀網(wǎng)絡(luò)可以通過(guò)許多參數(shù)來(lái)表征,例如網(wǎng)絡(luò)中分支點(diǎn)之間的平均距離,環(huán)路的大小以及相鄰節(jié)點(diǎn)具有的鏈路數(shù)量的比較 - 網(wǎng)絡(luò)規(guī)律性的度量描述異質(zhì)性。

然后,作者開(kāi)發(fā)了一種算法,該算法提出了可以保留網(wǎng)絡(luò)這些特征的鏈接。

他們通過(guò)采用已知網(wǎng)絡(luò)并從中刪除鏈接并查看算法是否可以預(yù)測(cè)缺失鏈接的位置來(lái)測(cè)試此方法。

該研究小組發(fā)現(xiàn)的算法(用于微網(wǎng)為性接觸網(wǎng)絡(luò)44%左右,大約15%和4%左右的水分配網(wǎng)絡(luò))為樹(shù)狀的網(wǎng)絡(luò)比大多數(shù)的依賴于其它參數(shù)的常規(guī)算法,例如進(jìn)行更好假設(shè)高度關(guān)聯(lián)的個(gè)體將吸引更多的連接(稱為優(yōu)先附著)或建立許多三角形連接(稱為聚類)。

作者Keke Shang將團(tuán)隊(duì)的成功歸功于思考現(xiàn)實(shí)世界網(wǎng)絡(luò)的例子。

“我希望我們能讓網(wǎng)絡(luò)技術(shù)更好地為我們的生活服務(wù),”他說(shuō)。


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