在美國用于鑒定棉藍(lán)病的下一代測序

由棉卷葉矮化病毒(CLRDV)引起的棉藍(lán)病是1949年在中非共和國首次報(bào)告的，直到2005年才在巴西報(bào)告。2017年，阿拉巴馬州發(fā)現(xiàn)了棉藍(lán)病，這是美國的第一份報(bào)告。

植物病理學(xué)家在阿拉巴馬州沿海的六個(gè)縣發(fā)現(xiàn)棉花上的葉片扭曲以及葉片卷曲和滾動。他們將樣品發(fā)送給了亞利桑那大學(xué)的植物病理學(xué)家朱迪思·布朗，后者最初懷疑該病原體是由粉虱傳播的雙生病毒，這是當(dāng)時(shí)已知的唯一一種感染棉花的病毒。但是，在使用Illumina平臺進(jìn)行發(fā)現(xiàn)基因組學(xué)進(jìn)行下一代測序后，Brown確定這些癥狀是棉藍(lán)病的特征。

棉藍(lán)病的特征性癥狀包括植物生長減慢和葉綠素?fù)p失，導(dǎo)致受感染的葉子和/或整個(gè)植物變黃或變矮。該疾病還抑制易位并由于營養(yǎng)缺乏而導(dǎo)致變紅。通常直到八月下旬盛開后才會出現(xiàn)癥狀。

為了更多地了解該疾病的控制選擇，布朗研究了巴西使用的管理策略。那里的策略集中在通過控制雜草消除水庫宿主和防止志愿棉植物的生長;后者在阿拉巴馬州結(jié)冰的地區(qū)不成問題。在巴西，化學(xué)品被用來控制將疾病轉(zhuǎn)移到棉花的昆蟲，但這在美國不是一種選擇。目前尚無推薦的治療棉藍(lán)病的方法。需要進(jìn)行其他研究以確定有效的管理策略。布朗鼓勵(lì)研究人員專注于遺傳抗性。

在兩個(gè)“關(guān)注棉花”網(wǎng)絡(luò)廣播中介紹了在阿拉巴馬州發(fā)現(xiàn)棉花藍(lán)色疾病的完整故事：33分鐘的“向美國介紹棉花卷葉矮化型桿狀病毒介紹：高通量發(fā)現(xiàn)，鑒定和《基因組比較》，作者：朱迪思·布朗(Judith K. Brown)，以及13分鐘的“棉花卷葉矮小病毒引起的棉花藍(lán)?。鸿b定，癥狀和在阿拉巴馬州的發(fā)生”，作者：凱西·勞倫斯(Kathy S. Lawrence)。

兩種介紹都可以通過植物管理網(wǎng)絡(luò)上的“棉花焦點(diǎn)”資源獲得。該資源包含超過75個(gè)網(wǎng)絡(luò)廣播，以及六個(gè)會議的演講，涉及棉花作物管理的廣泛方面：農(nóng)藝實(shí)踐，疾病，收獲和軋花，昆蟲，灌溉，線蟲，精準(zhǔn)農(nóng)業(yè)，土壤健康和作物肥力，和雜草。這些網(wǎng)絡(luò)廣播可供讀者打開訪問(無需訂閱)。